Причина «непостижимой эффективности математики» в естественных науках может быть связана с различной природой объектов естественных наук и математики. 1 Математический язык приспособлен для формулировки физических законов, что позволяет анализировать конкретные физические объекты и их свойства. 15

Также, по мнению некоторых учёных, эффективность математики в решении важных задач становится непостижимой при отсутствии связи между первоначальной целью разработки математического аппарата и его последующим использованием. 2 Например, дифференциальное исчисление, выросшее из исследований Исаака Ньютона, посвящённых движению планет, позволяет осуществлять статистическую оценку народонаселения, объяснять изменения количества рыбы, выловленной в Адриатическом море во время Первой мировой войны, и помогать инженерам конструировать пассажирские самолёты. 2

Ещё одна возможная причина «непостижимой эффективности» — точность языка математики, которая выступает приоритетом в сравнении с естественным языком. 1