Преимущества ультрафиолетовой микроскопии по сравнению с видимым светом:

• Повышенная разрешающая способность. 2 Предельная разрешающая способность микроскопа увеличивается приблизительно в два раза. 2
• Улучшенная контрастность. 1 Это связано с тем, что многие минеральные и органические пигменты в ультрафиолетовой области имеют более интенсивные, чем в видимой, максимумы поглощения. 4
• Возможность выявить структуру объектов, содержащих частицы, прозрачные в видимом свете, но сильно поглощающие ультрафиолетовое излучение определённых длин волн (как правило, это компоненты растительных и животных клеток). 2
• Возможность наблюдать структуру объектов, содержащих частицы, которые в ультрафиолетовой области спектра отражают лучи иначе, чем в видимой области (как правило, это большинство металлов и минералов). 2