Преимущества метода капиллярного электрофореза по сравнению с другими методами анализа воды:

• Высокая эффективность разделения компонентов смесей в кварцевом капилляре (сотни тысяч теоретических тарелок). 12
• Возможность одновременного определения нескольких компонентов пробы в ходе одного анализа. 13
• Разделение различных компонентов: ионных, нейтральных, гидрофильных, гидрофобных, хиральных, от наночастиц до макромолекул. 12
• Быстрота проведения анализа. 12
• Крайне низкий расход реактивов и растворителей (микролитры). 12
• Дозирование минимального объёма анализируемого образца. 1
• Простая подготовка пробы: в основном лишь фильтрование, дегазирование и разбавление. 12
• Отсутствие дорогостоящих колонок с сорбентами и проблем с их старением и заменой. 2
• Низкая стоимость единичного анализа. 12