Некоторые преимущества клонального микроразмножения перед традиционными способами размножения растений:

• Получение генетически однородного посадочного материала. 34
• Освобождение растений от вирусов за счёт использования меристемной культуры. 13
• Высокий коэффициент размножения. 13 Для травянистых растений он составляет 10⁵–10⁶, для кустарников — 10⁴–10⁵, для хвойных — 10⁴. 13
• Сокращение продолжительности селекционного процесса. 13
• Ускорение перехода растений от ювенильной к репродуктивной фазе развития. 13
• Размножение растений, которые трудно размножать традиционными способами, например, орхидей. 4
• Возможность проведения работ в течение года и экономия площадей, необходимых для выращивания посадочного материала. 13
• Возможность автоматизации процесса выращивания. 1
• Массовое выращивание растений с заданными качествами: например, с более высокой скоростью роста или образующими более компактные кусты. 4