Некоторые преимущества капиллярного электрофореза перед другими методами разделения биомолекул:

• Высокая эффективность разделения компонентов смесей (сотни тысяч теоретических тарелок). 12 Это объясняется уникальным свойством электроосмотического потока в кварцевом капилляре формировать плоский профиль, который не вызывает при движении зон компонентов их уширения. 3
• Многообразие вариантов метода. 1 Разделяются ионные, нейтральные, гидрофильные, гидрофобные, хиральные компоненты, от наночастиц до макромолекул. 1
• Быстрота проведения анализа. 12
• Крайне низкий расход реактивов и растворителей (микролитры). 1
• Дозируется минимальный объём анализируемого образца. 1
• Простая подготовка пробы для большинства объектов — в основном лишь фильтрование, дегазирование и разбавление. 1
• Отсутствие дорогостоящих колонок с сорбентами и проблем с их старением и заменой. 1
• Низкая стоимость единичного анализа. 1