Некоторые преимущества использования флуоресцентных белков в молекулярной биологии:

• Возможность наблюдать процессы, протекающие в организме. 1 Благодаря генной инженерии учёные могут вставить в определённое место генома ген, кодирующий флуоресцентный белок, и по появлению флуоресценции определять, когда и как «работает» данный участок генома. 1
• Изучение расположения определённых белков в клетке и в организме. 1 Последовательность нуклеотидов, отвечающую за кодирование флуоресцентного белка, вставляют в ДНК вместе с той, которая кодирует интересующий учёного белок. 1 В результате по флуоресценции возможно определять, какие белки локализуются в ядре, а какие в комплексе Гольджи. 1
• Исследование быстрых процессов. 2 Флуоресценцию удобно использовать для изучения сворачивания и динамики отдельных белковых молекул. 2
• Многоцветное мечение. 14 Если в распоряжении исследователя есть несколько разных флуоресцентных белков, их можно внедрить в один организм или в одну клетку и наблюдать одновременно ряд процессов. 1
• Использование в исследованиях в области фармацевтической химии. 1 Когда из огромного множества кандидатов подбирается вещество, дающее необходимый эффект, это удобно делать на клеточных культурах, модифицированных так, что эффект сопровождается экспрессией флуоресцентного белка. 1 Тогда по наличию и интенсивности свечения можно быстро определить подходящее вещество. 1