Отличие трансбиотического взаимодействия от нейтрального заключается в характере взаимоотношений между организмами:

1. Трансбиотическое взаимодействие — это тип взаимодействия, при котором одни организмы влияют друг на друга посредством третьих. 12 Например, если скот поедает только избирательные растения, то это приводит к тому, что разрастаются травы, которые этот же скот в пищу не употребляет. 1
2. Нейтральное взаимодействие — это отсутствие взаимоотношений, при котором совместно обитающие на одной территории организмы прямо никак не влияют друг на друга. 35 Например, белки и лоси в одном лесу прямо не контактируют друг с другом и не конкурируют за ресурсы среды. 3

Таким образом, при трансбиотическом взаимодействии влияние происходит обходным путём через влияние на третий вид, в то время как при нейтральном взаимодействии организмы не оказывают прямого воздействия друг на друга.