Отличие современной системы классификации от линнеевской заключается в том, что современная систематика учитывает историческое развитие и родство организмов при их классификации, а классификация Линнея не основывалась на анализе происхождения организмов и их родства. 1

Линнеевская классификация опиралась на констатацию внешних морфологических признаков живых организмов и их географическое распространение. 5 При этом учёный часто использовал только один признак, а не целый комплекс, из-за чего родственные организмы могли оказаться в разных таксономических группах, а неродственные — в одной. 25

Современная систематика базируется на признаках внутреннего строения растений и животных, особенностях строения клеток и их хромосомного аппарата, а также химическом составе и экологических особенностях живых организмов. 5