Отличие современной биологической классификации от системы Линнея заключается в том, что современная систематика учитывает историческое развитие и родство организмов при их классификации, а классификация Линнея не основывалась на анализе происхождения организмов и их родства. 14

Система Линнея идентифицировала и организовывала все организмы на основе их наблюдаемых признаков, особенно сходств и различий между ними. 7 Например, птицы были разделены учёным на систематические группы в зависимости от формы клюва, а цветковые растения — на основании количества тычинок и пестиков. 4

Современная систематика для классификации организмов использует целый комплекс признаков. 4 Учитываются, например, их внешнее и внутреннее строение, история эволюционного развития на основе палеонтологических данных, процессы жизнедеятельности и биохимические особенности, эмбриональное развитие, особенности строения клеток, кариотип, распространение на планете. 4 Это позволяет классифицировать организмы на основании их эволюционного родства, а не только сходства по тому или иному признаку. 4