Отличие селекции чистокровных пород от создания новых гибридных видов заключается в используемых методах и целях:

1. Селекция чистокровных пород направлена на сохранение и совершенствование желательных признаков и свойств, характерных для определённой породы. 36 Для этого используют чистопородное разведение, при котором спаривают животных одной породы. 13
2. Создание новых гибридных видов осуществляется путём гибридизации — процесса образования потомства с новыми свойствами от наследственно различающихся между собой родительских организмов 258. Гибридизация может происходить в пределах одного вида (внутривидовая) и между разными систематическими группами (отдалённая). 58

Таким образом, селекция чистокровных пород фокусируется на сохранении и улучшении уже существующих пород, в то время как создание новых гибридных видов направлено на получение потомства с новыми качествами путём скрещивания разных видов или пород 138.