Отличие подземных и надземных вегетативных органов заключается в их расположении и функциях:

• Подземные вегетативные органы (клубень, корневище, луковица) расположены под землёй и играют роль хранилища питательных веществ на случай неблагоприятных условий, а также являются органами вегетативного размножения. 24
• Надземные вегетативные органы (колючки, усики, кладодий, филлокладий, псевдобульба) развиваются над поверхностью земли и могут выполнять функции уплотнения, одеревенения или значительного расширения всего побега или отдельных его частей. 2

Таким образом, основное отличие заключается в том, что подземные органы выполняют специфические функции хранения питательных веществ и вегетативного размножения, в то время как надземные органы выполняют функции уплотнения, одеревенения и значительного расширения побега или его частей.