Отличие онтологической и методологической редукции в философии биологии заключается в следующем:

1. Онтологическая редукция — это идея о том, что каждая конкретная биологическая система (например, организм) состоит только из молекул и их взаимодействий. 1 Она предполагает, что биологические свойства вытекают из физических свойств и каждый конкретный биологический процесс метафизически идентичен некоторому конкретному физико-химическому процессу. 1
2. Методологическая редукция — это принцип исследования, согласно которому сложные явления объясняются с помощью законов, которые характерны для более простых явлений. 5 Он предполагает выделение базового фундаментального уровня существования, к которому сводятся все остальные уровни. 5

Таким образом, онтологическая редукция фокусируется на онтологическом аспекте биологических систем, а методологическая — на методологическом принципе объяснения сложного через более простое. 15