В чем отличие научной аннотации от популярной?

Возможно, имелись в виду различия между аннотациями к разным типам текстов, а не между научными и популярными.

Аннотация к научной работе призвана дать вводные данные об актуальности объекта и предмета исследования, указать фокус, методы, краткие выкладки по результатам и концепцию школы, в рамках которой рассматривается вопрос. 1 Такие аннотации пишут для статей, рефератов, дипломов и диссертаций. 2 Они включают цель исследования, методы, результаты и выводы. 24

Аннотация к художественному произведению, в отличие от научно-популярных и просветительских трудов, носит развлекательный характер. 1 Её задача — ознакомить и заинтересовать содержанием, а также мотивировать приобрести произведение. 1 В такой аннотации нужно познакомить читателя с главными действующими лицами, обозначить сюжет, указать на интригующие повороты, но исключить спойлеры. 1

Таким образом, отличие научной аннотации от популярной заключается в целях и содержании: научная аннотация фокусируется на передаче ключевых моментов научного изыскания, а аннотация к художественному произведению — на развлечении и мотивации читателя.