Отличие между речевыми конструкциями «что делаешь» и «чего делаешь» заключается в их использовании:

• Форма «Что делаешь?» более универсальная и формальная, подходит для общения со старшими людьми, незнакомыми, а также в официальных и деловых ситуациях. 1
• Форма «Чего делаешь?» более разговорная и неформальная, она уместна при общении с близкими друзьями, родственниками или людьми, с которыми можно общаться в неформальной обстановке. 1

В литературной речи возможен только вариант «что делаешь». 3 Фразы «чего делаешь» или «че делаешь» — это просторечные варианты, в устной и письменной литературной речи они не употребимы. 3