Основное отличие государственной экзаменационной комиссии (ГЭК) от апелляционной комиссии заключается в их функциях.

ГЭК проводит государственную итоговую аттестацию (ГИА) и определяет, соответствуют ли результаты освоения обучающимися основных образовательных программ требованиям образовательного стандарта. 24 Некоторые функции ГЭК:

• принимает решение о допуске на государственный экзамен опоздавших обучающихся; 14
• принимает решение об удалении обучающегося с экзамена при использовании средств связи, заранее подготовленных письменных материалов, а также при консультировании с другими обучающимися во время проведения экзамена; 14
• при проведении экзамена в устной форме заслушивает ответ каждого обучающегося в отдельности; 14
• проверяет письменные работы обучающихся; 14
• разрешает обучающемуся в случае необходимости на время покинуть аудиторию. 14

Апелляционные комиссии рассматривают апелляции о нарушении, по мнению обучающегося, установленной процедуры проведения государственного аттестационного испытания и (или) о несогласии с результатами государственного экзамена. 14 Некоторые функции апелляционных комиссий:

• принимает решение об отклонении апелляции, если изложенные в ней сведения о нарушениях процедуры проведения экзамена не подтвердились и (или) не повлияли на результат экзамена; 25
• принимает решение об удовлетворении апелляции, если изложенные в ней сведения о допущенных нарушениях процедуры проведения экзамена подтвердились и повлияли на результат экзамена; 25
• в случае удовлетворения апелляции результат проведения экзамена аннулируется. 35

Таким образом, ГЭК занимается проведением ГИА, а апелляционные комиссии — рассмотрением апелляций по её результатам.