Отличие гибридизации in situ (ISH) от иммуногистохимии (ИГХ) заключается в объекте исследования и методе диагностики:

1. Гибридизация in situ (ISH) позволяет визуализировать генетические изменения, определяя положение специфической последовательности ДНК на метафазных хромосомах или в интерфазных ядрах in situ. 25 Для этого используют ДНК-зонды, которые связываются с комплементарными мишенями в образце. 25 Каждая копия гена визуализируется в виде отдельной «точки». 1 В отличие от ИГХ, в ISH всегда присутствует внутренний стандарт. 1

2. Иммуногистохимия (ИГХ) направлена на выявление белков в тканях с помощью специфической реакции антиген-антитело. 69 Для этого готовые гистологические препараты обрабатывают специальными реактивами, содержащими меченые специфические антитела к выявляемому веществу. 9 Если искомое вещество находится в исследуемом материале, то антитело связывается с его определёнными участками. 9 В результате этого между ними образуется комплекс и происходит окрашивание ткани. 9