Отличие фазово-контрастной микроскопии от других методов исследования клеток заключается в том, что она позволяет изучать живые и неокрашенные объекты за счёт повышения их контрастности. 3

С помощью фазово-контрастного устройства различия в фазе световых лучей при прохождении их через прозрачные объекты превращаются в амплитудные, в результате чего объекты становятся контрастными. 4

Другие методы исследования клеток, например, световая микроскопия, основаны на том, что лучи света проходят через прозрачный объект и попадают затем на систему линз объектива и окуляра микроскопа. 58

Метод центрифугирования используется для изучения отдельных клеточных структур: клетки предварительно измельчают, центрифугируют и изучают отдельные образовавшиеся фракции. 58

Метод мечёных атомов предназначен для изучения места совершения тех или иных биохимических процессов в клетке: один из атомов определённого клеточного элемента заменяют радиоактивным изотопом, что позволяет наблюдать миграцию, локализацию и превращение этих веществ в клетке. 58

Метод культуры клеток и тканей даёт возможность исследовать под микроскопом движение, рост и деление клеток, изучать влияние на клетки различных физических и химических факторов: клетки выращивают в специальных питательных средах и наблюдают за их ростом и размножением вне организма 158.