Отличие файловой структуры от древовидной структуры каталогов заключается в следующем:

1. Файловая структура — это способ организации файлов на диске, который может быть одноуровневым (простая последовательность файлов) или многоуровневым (иерархический способ). 14
2. Древовидная структура каталогов — это иерархическая структура, состоящая из набора файлов и каталогов, где каждый каталог может содержать внутри себя множество файлов и вложенных каталогов (подкаталогов). 12

Таким образом, основное отличие в том, что файловая структура фокусируется на организации файлов, а древовидная структура каталогов — на организации каталогов и их взаимосвязи с файлами.