Особенности метода обратной ПЦР (ОТ-ПЦР):

1. Применение, если в качестве искомого генетического материала выступает не ДНК, а РНК вируса. 5 У некоторых патогенов, например вируса гепатита C, генетический материал представлен только РНК — однонитевой цепочкой нуклеотидов, в отличие от двухцепочечной ДНК-молекулы. 5 Она тоже несёт в себе генетическую информацию, но не подходит для стандартной ПЦР. 5
2. Превращение одноцепочечной молекулы РНК в комплементарную ДНК. 4 Для этого применяют реакцию обратной транскрипции, в которой фермент обратная транскриптаза по матрице РНК строит комплементарную ДНК (кДНК). 1
3. Использование кДНК в качестве матрицы для обычной ПЦР. 1 К одноцепочечной РНК-матрице присоединяется праймер, и обратная транскриптаза синтезирует цепь ДНК, которая потом сама уже служит матрицей для синтеза ДНК в процессе обычной ПЦР. 1

ОТ-ПЦР незаменима при работе с вирусами, геном которых представлен молекулой РНК, в диагностике некоторых видов рака по специфическим транскриптам опухолевых клеток, а также в генной инженерии. 1