Глубинное культивирование заключается в выращивании микроорганизмов в большом объёме жидкой фазы, которая содержит все необходимые для развития питательные вещества. 3 Некоторые особенности этого метода:

• Проводится в специальных аппаратах — ферментаторах, которые снабжены мешалками и системой подвода стерильного воздуха. 5
• Подходит для выращивания как аэробных, так и анаэробных микроорганизмов. 7
• Позволяет исключить тяжёлый непроизводительный ручной труд, сократить производственные площади, обеспечить высокий уровень стерильности процесса и улучшить гигиену труда. 7
• Даёт возможность осуществлять непрерывный процесс ферментации и более полно использовать питательные вещества среды. 7

Поверхностное культивирование заключается в выращивании аэробных микроорганизмов на поверхности жидких и сыпучих питательных сред. 5 Некоторые особенности этого метода:

• Проводится в стеклянной посуде с широким дном: чашках Петри, колбах Виноградского, матрацах, кюветах. 1
• Микроорганизмы развиваются на поверхности среды и используют кислород непосредственно из воздуха. 1
• На жидких средах микроорганизмы растут в виде плёнок. 5
• На плотных средах микроорганизмы растут в виде отдельных колоний или сплошным газоном. 1
• В лабораторных условиях применяется для получения накопительных и чистых культур, их хранения, изучения морфологических, культуральных и биохимических признаков микроорганизмов. 1

Таким образом, основное отличие заключается в том, что при глубинном культивировании микроорганизмы развиваются во всём объёме среды, а при поверхностном — на её поверхности. 5