Основные отличия трансформизма от метафизического материализма:

1. Трансформизм — это теория, доказывающая, что в основе всех изменений в природе лежит переформирование или перерождение одних организмов в другие. 1 Последователи трансформизма отрицали воззрения метафизиков и креационистов о постоянстве видов и роли Творца. 1
2. Метафизический материализм полагает в основе бытия неизменную и изначальную материю, меняющуюся лишь в своих формах, но не в сущности. 6 Идея неизменности, сохранения была заложена в самом фундаменте материализма. 3

Таким образом, трансформизм акцентирует внимание на изменениях видов, в то время как метафизический материализм предполагает неизменность материи как таковой.