Основные отличия муниципальных автономных школ от казённых:

1. Автономные школы обладают большей самостоятельностью и относительной независимостью. 1 Они могут самостоятельно распоряжаться денежными средствами, брать кредиты в банковских учреждениях, участвовать в финансовых операциях. 1 Собственник имущества автономного учреждения не несёт ответственности по его обязательствам. 39

2. Казённые школы максимально ограничены в проявлении какой-либо инициативы. 3 Их деятельность финансируется за счёт средств бюджета на основании бюджетной сметы. 34 Расходование бюджетных средств полностью контролируется учредителем. 4 Казенные учреждения не могут самостоятельно распоряжаться своими внебюджетными доходами, все полученные доходы подлежат зачислению в бюджет. 4

Кроме того, казённые учреждения в обязательном порядке ежегодно согласовывают своё штатное расписание и смету расходов с учредителем, а автономные имеют возможность формировать, корректировать и утверждать свои финансово-хозяйственные планы в соответствии с поступившими на лицевые счета средствами. 2