Основной недостаток философии диалектического материализма заключается в неспособности объяснить, каким образом движения материальных частиц могут произвести психические состояния. 1 Чувства, желания, акты внимания глубоко отличны от материальных процессов: они имеют временную форму и лишены пространственной, тогда как материальные процессы имеют временную и вместе с тем пространственную форму. 1

Также к недостаткам диалектического материализма относят отрицание свободы воли и приверженность детерминизму: все события возникают под влиянием причин, за которыми следует действие по определённому вечно неизменному закону. 1

Ещё один вариант недостатка — отрыв от естествознания, так как диалектический материализм формировался под влиянием позитивизма и гегелевской философии, которая была спекулятивной и оторванной от развития естествознания. 3