BPwin работает с тремя нотациями моделирования: IDEF0, IDEF3 и DFD. 12

IDEF0 позволяет представить систему совокупностью взаимодействующих работ (функций). 1 Это помогает определить состав функций системы и их взаимосвязь, выполнить оптимизирующую перестройку бизнес-процессов, оценить объём и распределение автоматизируемых функций. 1

IDEF3 описывает функционирование как набор сценариев, реализующих выполнение логических последовательностей функций при решении поставленных задач. 1 Это даёт возможность оценить корректность функционирования системы в различных ситуациях и основу для имитационного моделирования работы системы. 1

DFD также представляет систему совокупностью взаимодействующих функций, но дополнительно используются средства для представления внешних объектов, с которыми взаимодействует система, и средства хранения данных, используемых функциями, что позволяет определять внешние потоки и состав БД. 1

Кроме того, BPwin допускает создание смешанных моделей, использующих различные нотации на разных уровнях детализации. 1