Китовая акула в дикой природе может встречаться с некоторыми другими животными, например:

• Рыбы-лоцманы. 34 Как правило, возле китовой акулы постоянно держится большое количество таких рыб. 34
• Другие акулы. 12 Китовые акулы подвергаются нападениям марлинов, синих и белых акул. 2 Как правило, самыми уязвимыми для хищников являются молодые особи, но случаются нападения и на взрослых рыб. 2
• Косатки. 1 Хотя такие встречи происходят не так часто, так как китовые акулы обитают в тёплых водах, а косатки — в более холодных, где есть их любимая добыча: морские львы, тюлени и пингвины. 1
• Дельфины. 2 Китовая акула может стать жертвой дельфинов, если те будут атаковать её всей группой. 2