Значение реконструкции филогенетических рядов заключается в следующем:

• Понимание процесса эволюции конкретной группы организмов. 2 Можно увидеть последовательность появления и исчезновения различных видов, а также выявить общие черты и отличия между ними. 3
• Восстановление картины целой эпохи и происходящих в ней изменений. 2
• Подтверждение, что все организмы произошли друг от друга в процессе эволюции. 2
• Помощь в систематизации организмов и нахождении места каждого вида в общей системе классификации. 2

Исследование филогенетических рядов, построенных на основе данных палеонтологии, сравнительной анатомии и эмбриологии, важно для дальнейшего развития общей теории эволюции. 4

Для построения филогенетических рядов учёные всё больше привлекают данные таких наук, как генетика, биохимия, молекулярная биология, биогеография, этология и других. 4