Змееяд считается уязвимым видом в Европе по нескольким причинам:

• Снижение популяции змей, которыми питаются птицы. 5 Это связано с их уничтожением людьми, а также с сокращением пригодных мест для обитания змееядов. 5
• Угрозы для гнездовой группировки при разработке верховых болот, рубке леса и пожарах в краевых участках болот (основной гнездовой биотоп змееяда). 2
• Охота и туризм в местах, пригодных для гнездовья птицы. 3
• Низкая репродуктивная способность. 5 Взрослые особи часто подвергаются нападениям других хищников, которые легко отбирают у них добычу. 5