Жгутики грамотрицательных и грамположительных бактерий имеют различия в строении, так как отличаются по составу клеточной стенки. 14

У грамотрицательных бактерий более тонкая клеточная стенка (15–20 нм), а пептидогликан составляет 5–10% её массы. 4 У грамположительных бактерий клеточная стенка толще (50 нм и более), 40–80% её составляет пептидогликан. 4

В результате у грамотрицательных бактерий в базальном тельце жгутика есть две пары колец: внешняя (кольца L и Р) и внутренняя (кольца S и М). 1 Жгутики грамположительных бактерий содержат только одну пару колец — S и М. 1