Жгутики бактерий, в том числе архебактерий, не видны в световой микроскоп из-за их размеров. 24 Толщина жгутиков составляет 10–20 нм, что намного меньше предельной разрешающей способности светового микроскопа, равной примерно 200 нм. 2

Чтобы разглядеть жгутики, применяют специальные красители, которые, испаряясь, оставляют осадок вокруг жгутиков и делают их косвенно видимыми в обычный световой микроскоп. 2 Для непосредственного наблюдения жгутиков используют электронную микроскопию. 2

Также жгутики выявляются при световой микроскопии только после специального окрашивания, например, серебрением по Морозову или окраской по Грею. 3 Например, при методе серебрения жгутики искусственно утолщаются и становятся видимыми в иммерсионном микроскопе. 4