Замена определённых групп в углеводной части нуклеиновых кислот может влиять на их пространственную структуру, потому что остатки дезоксирибозы и фосфорной кислоты располагаются по периферии спирали. 3
Пуриновые и пиримидиновые основания обращены внутрь спирали таким образом, что их плоскости перпендикулярны оси спирали и параллельны друг другу. 3 Между основаниями возникают гидрофобные взаимодействия, которые вносят больший вклад в стабилизацию двойной спирали, чем водородные связи между цепями. 34
Таким образом, замена групп в углеводной части может изменить расположение остатков, что может повлиять на пространственную структуру нуклеиновых кислот.
Например, в РНК вместо дезоксирибозы используется рибоза, что отражается на строении и пространственной структуре молекулы: она образует спиральную структуру за счёт связей между аденином и урацилом (пара A—У) и гуанином и цитозином (пара Ц—Г). 45