Ядерный матрикс считают важным компонентом клеточного ядра, потому что он выполняет следующие функции:

• Поддерживает форму и стабильность интерфазного ядра. 1 Это каркасная структура, которая позволяет ядру сохранять свою характерную морфологию и поддерживать определённое расположение его компонентов. 3
• Организует пространство. 3 Матрикс создаёт упорядоченную внутреннюю архитектуру ядра, на нём размещаются другие важные компоненты, такие как хроматин (ДНК с белками) и ядрышко (место сборки рибосом). 3
• Участвует в организации хроматина. 3 Сложная трёхмерная сеть ядерного матрикса обеспечивает пространственное разделение различных участков ДНК, что важно для регуляции экспрессии генов. 3
• Создаёт условия для эффективной работы ядерных ферментов. 3 Матрикс создаёт условия для эффективной работы ферментов, участвующих в репликации ДНК, транскрипции РНК и процессинге генетического материала. 3
• Служит «транспортной сетью» для перемещения РНК и белков внутри ядра. 3