Ядерный матрикс считается аналогом цитоскелета, потому что он представляет собой систему филаментов, которая поддерживает форму и пространственную компартментализацию клеточного ядра. 5

В отличие от цитоскелета, матрикс становится видимым только после обработки ядра детергентами, ДНКазой и растворами высокой ионной силы. 1 При такой обработке удаляется много компонентов, включая почти всю ДНК и мембраны, а остаются только нерастворимые белки и часть РНК. 1 Матрикс содержит короткие волокна, по размеру близкие к промежуточным филаментам, актину (но не к его фибриллярной форме) и ко многим другим белкам. 1

Однако не все исследователи признают существование ядерного матрикса в виде прочной, относительно стабильной сети фибриллярных белков, подобной цитоскелету цитоплазмы эукариот. 2