Почему выбор длины ридов важен при картировании транскриптома?

Выбор длины ридов важен при картировании транскриптома, потому что длинные риды упрощают сборку и обеспечивают глубину секвенирования. kpfu.ru

Некоторые преимущества длинных ридов:

• Однозначная локализация. sites.icgbio.ru elibrary.ru Для идентификации ридов с межэкзонной локализацией необходима последовательность определённой длины, которая прилегает к стыку сайта сплайсинга. sites.icgbio.ru elibrary.ru По мере увеличения протяжённости рида вероятность попадания стыка сайта сплайсинга в зоны рида, не позволяющие однозначно локализовать последовательность, уменьшается. sites.icgbio.ru elibrary.ru
• Разрешение повторов. ru.ruwiki.ru ru.wikipedia.org Чем длиннее риды, тем больше повторов можно разрешить. ru.ruwiki.ru ru.wikipedia.org
• Разрешение участков с ошибками. ru.wikipedia.org Длинные риды позволяют разрешать участки с ошибками. ru.wikipedia.org

Например, при изучении транскриптома мозга рекомендуют использовать технологии секвенирования, дающие длины ридов не менее 75 пар нуклеотидов. sites.icgbio.ru elibrary.ru