Вторичные метаболиты растений могут влиять на другие организмы, потому что они обладают биологической активностью. 4 Эти вещества защищают растение от различных вредителей и патогенов, участвуют в размножении растений, придают окраску и запах цветам и плодам, обеспечивают взаимодействие растений между собой и с другими организмами в экосистеме. 1

Например, фенольные соединения определяют взаимодействия между представителями растительного и животного царств. 2 Привлекающая насекомых и птиц окраска цветов, фруктов и семян обусловлена такими фенольными соединениями, как антоцианы, флавононы, флавонолы, нафтохиноны и меланины. 2 Алкалоиды защищают растения от поедания животными. 2 Юглон, который образуется в опавших листьях грецкого ореха, достаточно токсичен и подавляет развитие патогенной микрофлоры почвы и прорастание семян других видов. 2

Также вторичные метаболиты растений влияют на биоразнообразие и структуру сообщества ассоциированных растений и микробиомов. 5 Например, вызывают качественные и количественные сдвиги в пользу микроорганизмов, способных выполнять определённые функции. 5