Виды непарнокопытных относятся к исчезающим животным из-за сокращения их популяций вследствие охоты и разрушения жизненного пространства. 12
Сегодня дикие виды встречаются лишь в разрозненных реликтовых популяциях. 1 Например, исчезла квагга, близка к исчезновению лошадь Пржевальского. 1
По данным МСОП, четыре вида непарнокопытных — африканского осла, суматранского носорога, яванского носорога и чёрного носорога — определены как подверженные критической опасности исчезновения. 1 Пять других видов — зебра Греви, горная зебра, горный тапир, центральноамериканский тапир и индийский носорог — считаются подверженными опасности исчезновения. 1