Сложности при решении линейных уравнений с большим количеством переменных могут возникать по нескольким причинам:

• Вычислительная и пространственная сложность. 2 Чем больше размерность задачи, тем больше времени требуется для её решения. 2
• Погрешности округления. 2 При использовании стандартных типов данных языков программирования множество рациональных чисел, представимых без погрешности, существенно сужается. 2 Арифметические операции приходится выполнять приближённо, что часто даёт неудовлетворительные результаты. 2
• Нераспознавание особых случаев. 2 Методы, не ориентированные на безошибочные вычисления, как правило, не распознают случаи, когда система имеет бесконечное множество решений или не имеет их вообще, выдавая ошибочные ответы. 2
• Необходимость выполнения большого количества вычислительных шагов. 4 При преобразовании уравнений или использовании матричного подхода количество вычислительных шагов, в конечном счёте, равно количеству переменных системы в кубе. 4

Для решения некоторых систем уравнений с большим количеством переменных разработаны специальные математические методы. 5 Также во многих случаях увеличить скорость решения позволяет использование параллельных вычислений на нескольких компьютерах одновременно. 2