Эффект бутылочного горлышка в популяциях животных возникает из-за критического уменьшения численности популяции с последующим восстановлением. 12
Снижение численности может происходить периодически (например, в связи с ежегодным наступлением сезона, неблагоприятного для поддержания численности популяции) или единовременно — в результате катастроф. 23
В маленькой популяции представлены не все варианты генов (аллели), поэтому часть признаков вида утрачивается. 4 Даже если потом численность группы восстанавливается, утраченные аллели вернуться не могут. 4
В результате выжившая популяция будет иметь генофонд, сильно отличный от того, который она имела до сокращения численности. 1
Пример эффекта бутылочного горлышка — сокращение популяции гепардов, когда примерно 300 лет назад из всей популяции выжило лишь 7 особей. 1 Они дали потомство, и в результате численность восстановилась, но современные гепарды менее плодовиты и более подвержены болезням, чем их предки. 1