Виды-двойники представляют серьёзную проблему в систематике, потому что они морфологически не отличаются, однако являются генетически изолированными. 15

Это затрудняет различение двух видов, так как в процессе видообразования перестройка генотипа не всегда сопровождается изменениями морфологии фенотипа. 4 В результате любое тщательно проведённое таксономическое исследование часто приводит к открытию ранее неизвестных видов-двойников. 4

Распознавание таких видов возможно при нахождении биометрических различий, в экспериментах по скрещиванию, при установлении отличий в образе жизни, характере издаваемых звуков и других признаках. 4

Кроме того, изучение ископаемых остатков видов-двойников затруднено из-за отсутствия чётких критериев для диагностики. 3