Вид иногда трудно определить у прокариотических и бесполых организмов по нескольким причинам:

• Интенсивный горизонтальный перенос генов. 1 Он происходит между прокариотами, и существует значимый поток генов даже между отдалёнными группами бактерий и архей. 1
• Быстрые жизненные циклы. 2 Например, у бактерий, из-за чего эволюционные изменения могут происходить быстро. 2
• Отсутствие полового размножения. 13 Для бесполых организмов вид — это совокупность клонов, объединённых общей экологической нишей и поэтому эволюционирующих совместно, сходным образом. 1

Для определения вида у таких организмов используются другие критерии, например биохимический состав и данные о последовательности ДНК и РНК. 2