Учёт эволюционной истории таксонов в систематике важен по нескольким причинам:

• Отражение естественной общности организмов. 2 Современная система классификации учитывает признаки родства видов как с ныне живущими, так и с уже вымершими видами. 2 Такая система отражает этапы исторического развития живого мира. 2
• Возможность предсказывать свойства организмов. 2 Естественные классификации позволяют предсказывать наличие у организмов тех или иных свойств в зависимости от их положения в системе. 2
• Объединение отдалённых организмов. 5 Учёт эволюционной истории позволяет объединять в общей системе таксонов такие отдалённые организмы, как прокариоты, цветковые растения и позвоночные, на основании обоснованных суждений о генетическом родстве между ними. 5
• Понимание структуры таксономического разнообразия. 5 Если признавать, что таксономическое разнообразие есть результат биологической эволюции, то верное понимание его структуры возможно лишь в контексте эволюционной теории. 5