Учёт эмбриологических данных при сравнительном изучении организмов важен по нескольким причинам:

• Выявление общих черт в развитии различных видов. 5 На ранних стадиях зародыши разных организмов сходны друг с другом: у всех позвоночных есть головной, туловищный и хвостовой отделы, зачатки конечностей, по бокам тела — зачатки жабр. 3 По мере развития зародышей черты различия становятся всё более явными. 3
• Определение степени эволюционного родства. 1 Ранние стадии развития изменяются относительно редко, поэтому сравнительное изучение эмбрионов разных видов может быть источником сведений о степени эволюционного родства. 1
• Реконструкция хода эволюции. 1 Изучение развития зародышей современных организмов помогает реконструировать ход эволюции и даже позволяет предсказывать, какие палеонтологические находки могут быть сделаны в будущем. 1
• Понимание механизмов развития и адаптации. 5 Эмбриологические методы помогают установить родственные связи между видами, понять механизмы развития и адаптации, а также способствуют более глубокому пониманию биологического разнообразия на Земле. 5