Контроль хода амплификации в каждой пробирке с реакционной смесью важен, потому что позволяет обеспечить достоверность результатов полимеразной цепной реакции (ПЦР). 12

Некоторые причины, по которым необходим такой контроль:

• Технические ошибки. 1 Например, можно забыть добавить какой-либо компонент или саму ДНК. 1 Также возможно несоблюдение температурного режима хранения наборов реагентов или их частей, что влияет на результаты ПЦР. 1
• Примеси в препарате ДНК. 3 Они могут снижать эффективность реакции, а в некоторых случаях приводить к отсутствию специфических ампликонов даже при наличии искомого возбудителя. 3
• Образование побочных продуктов реакции. 4 Это может значительно уменьшить чувствительность системы и затруднить или сделать невозможным учёт результатов при проведении электрофореза. 45

Для контроля хода амплификации используют внутренний контроль — препарат ДНК, несхожий с ДНК искомого микроорганизма. 24 Если ампликоны нужного размера не образовались, но не образовались и ампликоны внутреннего контроля, это может говорить о технологических нарушениях или наличии в образце нежелательных примесей. 15 В таком случае результат реакции считается недостоверным. 15