Некоторые причины трудностей с постановкой знаков препинания в сложных предложениях с сочинительной связью:

• Наличие общего второстепенного члена или вводного слова. 13 Если два предложения, связанные сочинительной связью, имеют общий второстепенный член или вводное слово, то запятая между ними не ставится. 13
• Стык сочинительного и подчинительного союза. 1 Если между предложениями, соединёнными сочинительной связью, вклинивается придаточное предложение, относящееся к одному из этих предложений, то рядом с сочинительным оказывается подчинительный союз. 1 Запятая между сочинительным и подчинительным союзом ставится, если придаточное предложение легко убрать. 1
• Наличие общего элемента. 3 При наличии общего элемента (второстепенного члена, частицы, вводного слова) простые предложения в составе сложносочинённого объединяются в единое целое, произносятся без паузы, и запятая между ними не ставится. 3