Слова «настоянный» и «настоенный» имеют разные суффиксы, потому что они образованы от разных глаголов. 14
Слово «настоянный» образовано от глагола «настоять» с суффиксом «-ять-», поэтому в причастии пишется «-я-». 1
Слово «настоенный» образовано от другого глагола, поэтому в нём пишется суффикс «-е-»: «настоенный» (от «настоять» — глагол с суффиксом «-ить-»). 34