Несоответствие антикодона и кодона в процессе трансляции допускается благодаря механизму неоднозначного соответствия. 2 Он предполагает, что образование пары кодон-антикодон в двух первых положениях кодона происходит всегда по каноническим правилам, но в третьем положении возможно «качание» (неоднозначное соответствие). 2 Это объясняется тем, что конформация антикодоновой петли тРНК допускает значительную подвижность первого основания антикодона. 2
Несоответствие обычно не приводит к неправильному включению аминокислот в белок. 3 Это связано с тем, что аминоацил-тРНК связывает рибосомальный A-сайт в комплексе EF-1A–аминоацил-тРНК–GTP, и гидролиз GTP должен произойти до образования пептидной связи. 3 Некогнатное взаимодействие не способно вызвать этот гидролиз, поэтому некогнатная тРНК в конечном итоге диссоциирует с рибосомой. 3