Слова-исключения с буквосочетанием «цы» в русском языке возникли, потому что подавляющее большинство заимствованных слов с «ци» в корне. 12 После «ц» пишется «и» в соответствии с мягким или полумягким произношением тех звуков, которые передаются в русском языке буквой «ц». 1 Например: «цивилизация» (лат. сivilis), «цитата» (лат. citatum). 1

В русском же языке буква «ц» передаёт твёрдый звук, после которого может произноситься только [ы], но не [и]. 1 Поскольку заимствованных слов с «ци» в корне большинство, то русские слова с «цы» в корне (цыган, на цыпочках, цыплёнок, цыкнуть, цыц) попали в исключения. 12