Несколько причин, по которым в русском языке есть слова, начинающиеся на букву «ы»:

• Заимствования из тюркских и финно-угорских языков. 23 Передача начального звука заимствования через «ы» возможна только для заимствований из тех языков, где существует оппозиция «ы» — «и». 3 Таких языков очень немного, поэтому имён нарицательных, даже заимствованных, в русском языке не появилось, а те, что появились, адаптированы под более привычную русским фонетику. 3
• Названия населённых пунктов и рек. 4 Например, якутская река Ыгыатта, село Ынырга в Горном Алтае. 14
• Самостоятельные слова. 4 Например, «ыр» (песня у некоторых тюркских народов), «ыкать» (произносить звук «ы»), «ыканье» (произнесение звука «ы»), «ых» (междометие). 4