Сложная система написания частицы «не» в русском языке связана с нейтрализацией семантических противопоставлений частицы и приставки. 1

В древнерусском языке отрицательная частица имела особый синтаксический статус: она была связана не с отдельной лексемой, а с частью предложения. 1 По мере развития синтаксических и семантических отношений в предложениях значение отрицания начало сужаться. 1 Частица «передвинулась» в направлении отдельного слова. 1

В результате за счёт изменения синтаксического статуса отрицательной частицы развилось слитное её написание со словами, и сформировалась приставка «не-», иногда совпадающая по семантике с частицей и вызывающая трудности в написании. 1

Кроме того, написание «не» зависит от части речи, к которой относится слово. 24 Например, с наречиями существует многообразие случаев употребления «не», что связано с тем, что наречия образуются различными способами от разных частей речи. 2

Также на написание влияет контекст: например, «не» пишется раздельно при наличии противопоставления с союзом «а», в вопросах типа «Не … ли это …?» и со словами, пишущимися через дефис. 2