Возможно, имелись в виду буквосочетания, в которых произношение не совпадает с написанием, в том числе «ЧТ». 1

Это связано с тем, что в русском языке есть звуки, которые всегда мягкие, и их мягкость на письме не обозначается мягким знаком. 34

Например, в сочетании «ЧТ» буква «ч» произносится как «ш» в словах «что», «что-то», «чтобы», «кое-что», «ничто» и других однокоренных словах. 3

Единственное исключение — слово «нечто», его следует произносить согласно написанию, через «чт». 3

Чтобы правильно писать и произносить такие слова, их нужно заучивать. 1