Несколько причин, по которым в русском языке существует множество исключений в правилах чередования гласных:

• Исторические изменения в языке. 5 Во многих случаях чередование гласных — результат исторических изменений, когда одна гласная заменяла другую в определённых контекстах. 5
• Фонетические причины. 5 Они связаны с процессами ассимиляции, диссимиляции, гармонии гласных и другими явлениями, которые влияют на звуковой облик слов. 5
• Морфологические причины. 5 Они связаны с процессами образования слов, такими как словообразование с помощью приставок, суффиксов и окончаний. 5 В таких случаях гласные в корне могут чередоваться в зависимости от добавляемых аффиксов и морфологической структуры слова. 5

Кроме того, коллекция корней с чередованием постоянно пополняется, поэтому окончательных списков исключений и слов с чередованием нет. 1